«Облако» на страже здоровья

1 Марта 2016

Более чем десятилетний возраст облачных вычислений позволил эффективно применять их в различных областях науки, в том числе, в геномной медицине. После отмены в США в 2007 году запрета на хранение геномных данных в облачных хранилищах Национальными институтами здоровья (National Institutes of Health – NIH), объемы использования облачных технологий значительно увеличились.

servidores-virtuales.jpg

На начало 2016 года наиболее впечатляющие достижения в этой области включают:

  • Проект «Карциноидный анализ всех геномов» (Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes – PCAWG), который объединяет всю геномную информацию проектов Международного консорциума генома рака (International Cancer Genome Consortium – ICGC) и Атласа генома рака (The Cancer Genome Atlas – TCGA). Этот ресурс описывает более 2000 видов злокачественных опухолей и предоставляет контрольные образцы, которые охватывают более чем 30 видов злокачественных образований. Ученые будут использовать продукт компании EMBL – EBI Embassy Cloud и проводить исследования в высокопроизводительных вычислительных центрах в Университете Чикаго, Научно-исследовательском институте электроники и телекоммуникаций в Сеуле, Калифорнийском Университете в Санта-Крус, Токийском университете и Гейдельбергском центре персонализированной онкологии в немецком научно-исследовательском раковом центре.
  • Великобританский проект «100000 геномов» включает геномную информацию более чем 70000 людей, включая пациентов с редкими заболеваниями, зарегистрированных в Национальной службе здравоохранения, плюс семей таких пациентов.
  • Исследовательский институт трансляционной геномики Аризоны и Консорциум трансляционных исследований нейробластомы и медуллобластомы проводят персонализированные медицинские испытания с использованием высокопроизводительных облачных вычислений для создания новых лечебных баз данных, которые помогут определить подходы персонализированной лекарственной терапии для детей. Проект также был расширен и включил европейские страны, включая Францию и Ливан.

«Облачно-базированная геномика» (Cloud Powered Genomics) обеспечивает:

  • Скорость. Время, требуемое для обработки 90 миллиардов единиц данных, сокращено с 10 дней до 6 часов и менее.
  • Точность. Анализ нескольких терабайт данных теперь дает возможность врачам назначать процедуры, которые полностью соответствуют личности пациента вместо того, чтобы полагаться на процедуры, предназначенные для широкой базы больных.
  • Сотрудничество. Ученые и врачи по всему миру теперь могут поделиться диагностической и тематической информацией, опираясь на существующую базу массовых медицинских знаний, которая, в свою очередь, помогает повысить результативность и уточнить лечебные протоколы.
  • Масштабируемость. Возможности хранения и обработки данных растут пропорционально увеличению объемов собираемой информации.

В то время как облачные вычисления дают возможность исследователям и врачам эффективно анализировать огромные объемы данных, также поднимаются непростые вопросы о конфиденциальности. Признание Европейским судом недействительным соглашение Европы и США «Безопасная гавань» выносит сегодняшние вопросы безопасности на первый план.

Без оглашения конкретных деталей Европейская комиссия объявила о создании новых рамок для управления потоком данных через Атлантический океан. Соглашение, которое называется «Защитный экран», призвано удовлетворить все требования, установленные Европейским судом в постановлении от 6 октября 2015 года, согласно которому «Безопасная гавань» признана недействительной.

Российская медицина также начала в 2014 году покорять облачные вершины. Уже почти два года существует независимый архив медицинской литературы, базирующийся на использовании облачных технологий. В помощь российским медикам также предоставлен облачный ЦОД, сопровождением которого занимается независимая компания.